Considéré comme étant une énergie propre, le gaz naturel s'impose de plus en plus comme source énergétique alternative. Il va permettre à terme de convertir au gaz naturel, les centrales électriques européennes fonctionnant actuellement au charbon ou au fuel.

Le TSGP se propose de transporter des quantités importantes de gaz associés qui sont actuellement brûlées à la torche au niveau des gisements pétrolifères du Nigeria. Le TSGP aura donc un double avantage environnemental : il permettra d'une part de réduire considérablement l'impact sur l'environnement des gaz torchés au Nigeria et d'autre part, d’acheminer une source d'énergie propre à l'Europe qui en a grand besoin pour réduire ses émissions de CO2 dans l'atmosphère.

Pour les besoins de l'étude de faisabilité du projet, une étude initiale d'impact sur l'environnement a été élaborée afin de déterminer les incidences environnementales de la construction du pipeline. Cette étude a pris en considération les textes légaux des pays traversés et les orientations réglementaires internationales relatives à l'environnement. Les directives de la Banque Mondiale pour l'évaluation environnementale des projets énergétiques et industriels ont été particulièrement suivies. De même que les représentants des gouvernements concernés, les ONG et les représentants des populations environnantes aux tracés proposés ont été interrogés sur les aspects liés à l'impact environnemental du projet.

L'itinéraire global du TSGP traversera une grande variété d'écosystèmes et de paysages. Par ailleurs, en raison de la nature extrêmement aride du Sahara, les oasis et même le plus petit terrain marécageux revêtent une importance vitale sur les plans écologique, social et culturel. Pour cela, les oasis ont été particulièrement évitées par le tracé du TSGP.

Les effets environnementaux les plus importants du projet vont probablement apparaître pendant la phase de construction. Toutefois, le gazoduc étant enfoui, il n'aura pas d'incidence à long terme sur la faune et la flore des régions traversées.